流行病学epidemiology为查明发病原因而在人群中开展
研究。
难辨性梭状芽孢杆菌Clostridiumdifficile（C.diff）
种致病菌，3%人肠道内有难辨性梭状芽孢杆菌生长，通常它们与人和平共处，但在抗生素滥用、对其生长有抑制作用细菌被杀灭情况下，难辨梭菌会大量繁殖，在肠道占据主导地位。它会生成毒素，引起严重肠壁损伤（肠炎）。般来说，抗生素治疗对其无效，反而会增强其毒性。唯治疗方法是粪便微生物移植。
内分泌干扰物endocrinedisruptors能通过表观遗传作用改变激素水平化学分子，例如塑料奶瓶中所含双酚A。
内分泌器官endocrine任何能生成激素组织结构（如甲状腺、胰腺）。
内脏脂肪visceralfat肠道和肝脏周围积聚脂肪。过多内脏脂肪是心脏病和糖尿病风险因素
门Firmicutes肠道细菌大门类，许多种类厚壁菌与人体健康有关，基因会对其产生定影响。
荟萃分析meta-analysis将不同试验研究结果加以综合分析并得出概括性结论方法。与单个实验相比，得出结论更可信，不过如果纳入研究本身都存在偏倚，荟萃分析得到结果也会产生误导。
基因gene带有遗传信息DNA片段，能够控制蛋白质合成。人体每个细胞内有大约2万个基因。基因确切定义不同，数量估计也有差别。
酵母yeast种能将糖类转变成酒精和二氧化碳真菌。人们用酵母来生产面包和酿酒。可能可以促进有益菌生长。大部分酵母能在肠道和人和平共处，只有少数会致病，例如念珠菌。
结肠colon肠道下部。体内大部分细菌和微生物都位于结肠，它们消化分解上部小肠无法吸收富含纤维素食物。
结肠炎colitis由感染或自身免疫性疾病引起结肠炎症。
菊粉inulin种益生元化学物质，大大有利于有益菌繁殖。富含于朝鲜蓟、菊苣、大蒜、洋葱之中，面包中也有少量。
抗生素antibiotics微生物生成有防御作用化学物质，人类可以合成抗生素并用于治疗细菌感染。过去三十年中，人们没有开发出新抗生素，而许多细菌产生
耐药性。
抗氧化剂antioxidant任何能清除细胞代谢产生有害物质如自由基有益分子或物质。
克里斯滕森氏菌christensenella存在于许多人肠道内种古老细菌，研究发现它有预防肥胖作用。与产甲烷菌有关联。
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