除此以外，袁崇焕还公开上书为毛文龙请饷，因为东江镇这两年
军饷、军粮已经被袁崇焕贪污掉
，所以这次他要求皇帝再责令户部重新为东江镇凑十万两银子出来，这个条件被满足后，袁崇焕就向毛文龙发出邀请，约他到双岛讨论军饷问题。
在黄石原本历史上，袁崇焕在杀毛文龙后得意洋洋地吹嘘道，这番话、这批粮食以及其后种种布置都是他迷惑毛文龙计谋：“凡此，皆愚之也。”
……
崇祯二年五月二十日，辽阳
莽古尔泰进来时
试弟弟鼻息，接着又是脉搏，最后孙二狗轻轻拿衣服盖住他四弟脸庞，现在他也和白有才
样是孤身人。
孙二狗抬起头，盯着白有才眼睛严肃地问道：“为什
？朝廷到底为什要饿死
们？”
……
崇祯二年闰四月，毛文龙再三上书弹劾袁崇焕贪污东江军饷，并切断东江粮道。在他最后封控诉信里，毛文龙全面驳斥文官对他污蔑，首先是军饷问题：“其收本色百二十万八千有奇，折色百四十万千三百余两，名实不相应！日夕借囗粥苟全性命。切米豆布帛之类，不得不转贷四方之商贩，饷到而偿之，而岁饷竟无音耗！”
八年来拿百四十万银子和百万石米，平均到每年只是给七千人军饷和粮食，毛文龙争辩说，东江镇几十万军民拿七千兵饷粮，根本就连吃都吃不饱，又怎可能贪污？随后他又质问户部勘合兵员后只肯给东江镇半饷：“且兵给月银两四钱，米斛，此定额也。乃计部有军减半之说。臣以为同士兵，而关宁与东江作两视，不知作何主见！？”
洋洋洒洒份奏章中，毛文龙又尽情地喷发次怒火，最后他甚至把矛头指向整个文官阶层，冲着崇祯皇帝怒吼道：“实在是文臣误国，而非臣误国；诸臣独计除臣，不计除奴，将江山而快私忿，操戈矛于同室。”
崇祯看完奏章后，就把这份奏章转给辽东都司府，让袁崇焕作出解释。
这个时候袁崇焕已经和皇太极进行长达四个月议和，还写信给兵部尚书王洽寻求支持：“关东款议，庙堂主张已有其人。文龙能协心意，自当无嫌无猜；否则，斩其首，崇焕当效提刀之力……”
袁崇焕对毛文龙指控先是故作惊讶番，表示他根本不知道东江镇遇到困难，还当着众人面大言不惭地声称文官应该和武官通力合作。“文官不肯体恤武官，稍有不合，便思相中，成何体统。既乏饷，何不详来？”
当着中使和众人说完这段冠冕堂皇话后，袁崇焕就命令把天津运来粮饷拨十船发给来人，并写封亲笔信慰问毛文龙，还随船带犒赏银两，猪羊酒面之类。
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